As pragas urbanas representam um grande desafio para a biodiversidade, e os danos econômicos que causam excedem 5% do produto interno bruto global. Quando as pragas entram numa nova área, muitas vezes chegam sem inimigos naturais e a população pode explodir sem nada para impedi-la, o que pode expulsar as espécies nativas e perturbar o equilíbrio de ecossistemas únicos. O controlo de pragas contribui para a proteção da biodiversidade e do ecossistema local, considerando especialmente tendências como o aumento de viagens, a globalização e as mudanças climáticas.
O uso de biocidas para combater pragas também representa um desafio para a biodiversidade. Se forem usados em excesso ou de maneira inadequada, eles podem se espalhar para a água doce ou causar envenenamento não intencional por meio do consumo, seja diretamente ou através da cadeia alimentar. Portanto, o uso mais eficaz de biocidas, com detecção precoce e alternativas não tóxicas, torna-se essencial para minimizar os danos potenciais ao meio ambiente.